2004年3月1日2时47分，随着机组与电网解列，秦山二核1号机组第二次换料大修工作正式开始。
秦山二核1号机组第二次换料大修从3月1日开始，至6月3日重新并网发电结束，计划工期95天。其间，要完成2751项预防性维修、231项运行定期试验、128项性能试验、95项在役检查、87项技术改造和15项重大设备缺陷整治等共4087项任务目标。机组此次换料大修较第一次增加了一回路水压试验、安全壳密封性试验等三项重大试验。
秦山二核1号机组在去年第一次换料大修后的第二燃料循环，创造了良好的运行业绩。2003年机组全年发电46.17亿千瓦时，负荷因子达到81.2%。
